胶质瘤与转移瘤的鉴别
胶质瘤和转移瘤的瘤周病理生理不同：高级别胶质瘤是浸润性肿瘤，肿瘤组织沿血管浸润，因此瘤周T2异常信号区内仍混有肿瘤细胞；转移瘤瘤周则几乎纯粹是血管原性水肿，不含浸润的肿瘤细胞。这一差异是MRS和灌注成像鉴别的病理基础。
在波谱和灌注上，胶质瘤瘤周区表现为Cho升高和rCBV升高，而转移瘤瘤周区Cho不升高、rCBV也不升高。实际读片时，若瘤周T2高信号区出现Cho峰增高且rCBV增高，支持胶质瘤；若瘤周区Cho和rCBV均低，则支持转移瘤。
肿瘤样脱髓鞘病变与高级别胶质瘤的鉴别
肿瘤样脱髓鞘病变的波谱可与高级别胶质瘤有重叠：Cho升高源于星形胶质细胞聚集和脱髓鞘，乳酸升高反映局部无氧糖酵解和线粒体功能障碍，NAA减低提示神经元和轴索损伤。但两者仍有可区分的特征。
与高级别胶质瘤相比，肿瘤样脱髓鞘病变在中心区和强化区NAA/Cr升高，且没有血管生成，平均rCBV仅0.88，而胶质瘤以新生血管为特征，rCBV明显升高达6.47。结合灌注减低和NAA轻度减少，可鉴别肿瘤样脱髓鞘病变与高级别胶质瘤。
淋巴瘤的MRS表现
淋巴瘤的MRS表现为胆碱显著升高、NAA降低、脂质峰升高。胆碱升高反映细胞膜周转活跃，NAA降低提示神经元受损，脂质峰升高与细胞坏死相关。
在鉴别诊断中，淋巴瘤的rCBV稍高，可与胶质瘤的明显高灌注区分；转移瘤rCBV高，但淋巴瘤脂质峰更突出。结合灌注参数和波谱特征，有助于将淋巴瘤与其他颅内肿瘤区分。
不同脑肿瘤的代谢与灌注特征
不同级别胶质瘤的代谢物和灌注表现不同：4级胶质瘤Cho/Cr很高、NAA/Cr很低，并出现脂质/乳酸峰，rCBV很高；3级胶质瘤Cho/Cr高、NAA/Cr低，rCBV高；2级胶质瘤Cho/Cr中高、NAA/Cr中低，肌醇升高，rCBV低。大脑胶质瘤病Cho/Cr稍高、NAA/Cr正常、肌醇升高，rCBV低。
其他肿瘤也有各自特点：节细胞胶质瘤Cho/Cr和NAA/Cr正常，rCBV中高；淋巴瘤Cho/Cr高、NAA/Cr很低，出现脂质/乳酸峰，rCBV稍高；转移瘤Cho/Cr高、NAA/Cr很低，出现脂质/乳酸峰，rCBV高；脑膜瘤Cho/Cr中高、无NAA，出现丙氨酸和谷氨酸峰，rCBV很高；放射性坏死Cho/Cr和NAA/Cr均很低，出现脂质/乳酸峰，rCBV低；脱髓鞘病变Cho/Cr高、NAA/Cr低，出现脂质峰，rCBV低。这些特征组合有助于鉴别诊断。
